2024 Выпуск №1

В последние годы в исследованиях антимикробных пептидов (AMП) наблюдается значительный прогресс, раскрывающий потенциал этих соединений в качестве аль­тернатив традиционным антибиотикам. Благодаря разнообразным механизмам дей­ствия и широкому спектру противобактериальной активности AMП предоставля­ют новые возможности для профилактики и лечения инфекций с множественной ле­карственной устойчивостью путем создания продуктов питания с антимикробными свойствами, новых противомикробных биологически активных добавок и лекарствен­ных препаратов. Цель работы — создание, характеристика и классификация нового АМП. Для проектирования нового АМП использована протеомная база данных DRAMP, для прогнозирования биологической активности — Peptide Ranker (http:// distilldeep.ucd.ie/PeptideRanker), идентификацию пептида проводили по базе данных EROP-Moscow (http://erop.inbi.ras.ru/index.html), исследование физико-химических свойств — по базам данных APD, DRAMP и PepCalc (http://pepcalc.com). В результате исследований спроектирован новый АМП, состоящий из 11 аминокислотных остат­ков со следующем процентным содержанием: Val, Ala, Trp, Gly, Pro, Tyr, Glu, His, Lys — по 9 % и Arg — 18 %. Общее гидрофобное соотношение в пептиде, определяемое APD, составляет 27 %, общий чистый заряд равен + 2,25, молекулярная формула — C64H96N21O15S0, потенциал связывания с белками (индекс Бомана) — на уровне 3,44 ккал/моль, пептид может образовывать альфа-спираль. Полученный пептид мож­но классифицировать как синтезированный катионный гидрофобный альфа-спи­ральный противомикробный полипептид.

In recent years, significant progress has been achieved in AMP research, revealing the potential of these compounds as alternatives to traditional antibiotics. Due to the diverse mechanisms of action and a wide range of antibacterial activity, AMP provides new opportu­nities for preventing and treating multidrug-resistant infections by creating foods with anti­microbial properties, new antimicrobial biologically active additives and medicines. This study aimed to create, characterise and classify a new AMP. The DRAMP proteo­mic database was used to design the AMP, and the Peptide Ranker was utilised to predict biological activity (http://distilldeep.ucd.ie/PeptideRanker). The peptide was identified with the help of the EROP-Moscow database (http://erop.inbi.ras.ru/index.html), and its physio-chemical properties were studied using the APD, DRAMP and PepCalc databases (http://pepcalc.com). The research resulted in the design of a new AMP consisting of 11 ami­no acid residues with the following percentages: Val, Ala, Trp, Gly, Pro, Tyr, Glu, His, Lys by 9 % and Arg by 18 %. The total hydrophobic ratio in the peptide, determined by APD, is 27 %; the total net charge is +2.25. Its molecular formula is C64H96N21O15S0, with protein binding potential (Boman index) at 3.44 kcal/mol. The peptide can form an alpha helix. The resulting peptide can be classified as a synthesised cationic hydrophobic alpha-helical antimi­crobial polypeptide.

Субарктические российские реки обычно имеют заболоченные водосборы с высоким содержанием ионов водорода и гуминовых веществ. Эти условия благоприятны для образования биодоступной ртути. Таким образом, даже фоновые концентрации рту­ти могут представлять серьезную опасность для водных организмов. Река Северная Двина вызывает особый интерес с точки зрения ртутного загрязнения из-за располо­женных здесь целлюлозно-бумажных комбинатов (ЦБК), которые уже давно использу­ют ртуть в своих производственных циклах. Цель работы — анализ содержания ртути в рыбах, обитающих в устье Северной Двины и имеющих промысловое значе­ние. В ходе данного исследования были определены содержание и распределение ртути в образцах тканей различных видов рыб, представляющих собой компоненты ртутного цикла на исследуемой территории. Более низкие уровни ртути в нетронутых райо­нах Российской субарктики показали роль водных организмов как индикаторов биогео­химического цикла миграции ртути в северных пресноводных районах. Благодаря пуб­ликации работы в научный оборот вводятся новые данные о содержании ртути в ры­бах Северной Двины, преимущественно обитающих в ее устьевой зоне, находящейся под воздействием целлюлозно-бумажной промышленности. Содержание и распределе­ние ртути охарактеризовано на примере наиболее распространенных видов рыб. Пока­зана разница между накоплением ртути в разных условиях и территориально, прове­ден анализ влияющих факторов.

Subarctic Russian rivers tend to have swampy watersheds with a high content of hydro­gen ions and humic substances. These conditions are favourable for the formation of bioavail­able mercury. Thus, even background mercury concentrations can pose a danger to aquatic organisms. The Northern Dvina River attracts particular attention regarding mercury pollu­tion due to the presence of pulp and paper mills in the area. These mills have historically uti­lised mercury in their production processes. This study aims to analyse the mercury content in commercially important fish species living in the mouth of the Northern Dvina River. The content and distribution of mercury in tissue samples of various fish species were determined to provide insight into components of the mercury cycle in the study area. Lower mercury levels in pristine areas of the Russian subarctic showed the role of aquatic organisms as indicators of the biogeochemical cycle of mercury migration in northern freshwater areas. This study provides new scientific data on the levels of mercury found in fish from the Northern Dvina, particularly those in its estuary zone affected by the pulp and paper industry. The content and distribution of mercury were characterised using the most common fish species as an example. The difference was shown between mercury accumulation in different conditions and areas, with an analysis of relevant factors carried out.