Вестник Балтийского федерального университета им. И. Канта. Серия: естественные науки

2024 Выпуск №1

Классификация и характеристика нового антимикробного пептида

Аннотация

В последние годы в исследованиях антимикробных пептидов (AMП) наблюдается значительный прогресс, раскрывающий потенциал этих соединений в качестве аль­тернатив традиционным антибиотикам. Благодаря разнообразным механизмам дей­ствия и широкому спектру противобактериальной активности AMП предоставля­ют новые возможности для профилактики и лечения инфекций с множественной ле­карственной устойчивостью путем создания продуктов питания с антимикробными свойствами, новых противомикробных биологически активных добавок и лекарствен­ных препаратов. Цель работы — создание, характеристика и классификация нового АМП. Для проектирования нового АМП использована протеомная база данных DRAMP, для прогнозирования биологической активности — Peptide Ranker (http:// distilldeep.ucd.ie/PeptideRanker), идентификацию пептида проводили по базе данных EROP-Moscow (http://erop.inbi.ras.ru/index.html), исследование физико-химических свойств — по базам данных APD, DRAMP и PepCalc (http://pepcalc.com). В результате исследований спроектирован новый АМП, состоящий из 11 аминокислотных остат­ков со следующем процентным содержанием: Val, Ala, Trp, Gly, Pro, Tyr, Glu, His, Lys — по 9 % и Arg — 18 %. Общее гидрофобное соотношение в пептиде, определяемое APD, составляет 27 %, общий чистый заряд равен + 2,25, молекулярная формула — C64H96N21O15S0, потенциал связывания с белками (индекс Бомана) — на уровне 3,44 ккал/моль, пептид может образовывать альфа-спираль. Полученный пептид мож­но классифицировать как синтезированный катионный гидрофобный альфа-спи­ральный противомикробный полипептид.

Скачать статью

Содержание ртути в рыбе, выловленной ниже целлюлозно-бумажного комбината в Северной Двине

Аннотация

Субарктические российские реки обычно имеют заболоченные водосборы с высоким содержанием ионов водорода и гуминовых веществ. Эти условия благоприятны для образования биодоступной ртути. Таким образом, даже фоновые концентрации рту­ти могут представлять серьезную опасность для водных организмов. Река Северная Двина вызывает особый интерес с точки зрения ртутного загрязнения из-за располо­женных здесь целлюлозно-бумажных комбинатов (ЦБК), которые уже давно использу­ют ртуть в своих производственных циклах. Цель работы — анализ содержания ртути в рыбах, обитающих в устье Северной Двины и имеющих промысловое значе­ние. В ходе данного исследования были определены содержание и распределение ртути в образцах тканей различных видов рыб, представляющих собой компоненты ртутного цикла на исследуемой территории. Более низкие уровни ртути в нетронутых райо­нах Российской субарктики показали роль водных организмов как индикаторов биогео­химического цикла миграции ртути в северных пресноводных районах. Благодаря пуб­ликации работы в научный оборот вводятся новые данные о содержании ртути в ры­бах Северной Двины, преимущественно обитающих в ее устьевой зоне, находящейся под воздействием целлюлозно-бумажной промышленности. Содержание и распределе­ние ртути охарактеризовано на примере наиболее распространенных видов рыб. Пока­зана разница между накоплением ртути в разных условиях и территориально, прове­ден анализ влияющих факторов.

Скачать статью